El CEPET utiliza la tipología de IFEX (International Freedom of Expression Exchange), como referencia y categorías identificadas en la realidad Mexicana. Para la emisión de alertas se utilizan principios generalmente aceptados y aplicados por organizaciones internacionales de defensa de la libertad de expresión. Los que siguen son algunos de los criterios fundamentales: 

• Se consideran agresiones a la libertad de expresión aquellas que ocurren en contra de medios de comunicación y periodistas.
• La agresión constituye una violación a la libertad de expresión sólo si fue cometida por motivos del trabajo periodístico de la víctima, sea un periodista o un medio de comunicación. Este es el principio de vinculación.
• La información sobre los hechos es verificada con fuentes directa (proyecto actual iniciado en agosto, 2008).
• En caso de dudas sobre la vinculación, se expresa así y se considera una agresión hasta que la vinculación es corroborada o existen elementos suficientes para considerar que existe tal vinculación.

Se consultó con especialistas de cinco países sobre dilemas éticos relacionados con la defensa de la libertad d expresión y la corrupción del periodismo. El resultado sintético fue este:

•    Elementos esenciales para considerar que un ataque fue cometido por el trabajo periodístico de la víctima:
1) Comportamiento ético del periodista o medio de comunicación. 2) El móvil es coartar la libertad de expresión.
•    Los actos de corrupción de periodistas y medios de comunicación deben ser expuestos.
•    Pero si un medio o un periodista tienen mala reputación, de cualquier manera deben emitirse las alertas en caso de agresiones si es claro que fueron motivadas por el trabajo periodístico.
•    La mala reputación (como corrupto) de un medio de comunicación o un periodista es insuficiente para determinar que lo sea.
•    Si un medio de comunicación tiene reputación de corrupción, los periodistas que trabajan en él no necesariamente deben ser considerados corruptos.
•    Para determinar si un medio o periodista es corrupto es necesario:
Investigación y verificación con varias fuentes, buscar pruebas fehacientes, entrevista con el medio y el periodista. También una respuesta sugiere establecer una comisión de honorables que evalúe de forma regular el comportamiento ético de periodistas y medios.